Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PtpreP49446 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm37692-201ENSMUST00000192633 232 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtpreP49446 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms