Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PdgfraP26618 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms