Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ggta1P23336 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms