Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Hoxb1P17919 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Hoxb1P17919 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxb1P17919 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms