Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm24638-201ENSMUST00000179807 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Spta1P08032 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Spta1P08032 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Spta1P08032 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
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