Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Ccl20O89093 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms