Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 n-R5s218-201ENSMUST00000122583 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NebE9Q1W3 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms