Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm19131-201ENSMUST00000203408 789 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm22973-201ENSMUST00000083298 191 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Spocd1B1ASB6 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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