Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Prdm16A2A935 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Prdm16A2A935 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Prdm16A2A935 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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