Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms