Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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Col5a3Q9JLI2 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col5a3Q9JLI2 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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