Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn12Q9ET43 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms