Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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RpainQ9CWY9 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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RpainQ9CWY9 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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RpainQ9CWY9 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RpainQ9CWY9 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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