Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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