Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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ptchd1Q14B62 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ptchd1Q14B62 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms