Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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VdrP48281 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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VdrP48281 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
VdrP48281 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
VdrP48281 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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