Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm25835-201ENSMUST00000158917 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Rpl28P41105 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms