Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Hoxd9P28357 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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