Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Hoxb1P17919 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Hoxb1P17919 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxb1P17919 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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