Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Spocd1B1ASB6 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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