Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm9762-201ENSMUST00000036976 444 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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