Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
OtofQ9ESF1 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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