Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm26449-201ENSMUST00000082452 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RpainQ9CWY9 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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