Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Rprd1bQ9CSU0 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rprd1bQ9CSU0 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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