Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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Vipas39Q8BGQ1 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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Vipas39Q8BGQ1 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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Vipas39Q8BGQ1 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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Vipas39Q8BGQ1 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
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Vipas39Q8BGQ1 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
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Vipas39Q8BGQ1 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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