Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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