Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Sft2d1Q5SSN7 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Sft2d1Q5SSN7 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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