Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Samt2-201ENSMUST00000101137 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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