Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rnf180Q3U827 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnf180Q3U827 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnf180Q3U827 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnf180Q3U827 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rnf180Q3U827 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rnf180Q3U827 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rnf180Q3U827 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Rnf180Q3U827 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf180Q3U827 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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