Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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Sh3bp2Q06649 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Sh3bp2Q06649 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms