Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DffaO54786 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms