Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AI504432-201ENSMUST00000070085 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Usp9yF8VPU6 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Usp9yF8VPU6 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms