Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Tmf1B9EKI3 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tmf1B9EKI3 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms