Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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