Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Cldn6Q9Z262 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Cldn6Q9Z262 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn6Q9Z262 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms