Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr178-201ENSMUST00000058564 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Mup6-203ENSMUST00000107521 642 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Cldn8Q9Z260 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Cldn8Q9Z260 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms