Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Col4a3Q9QZS0 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms