Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm24379-201ENSMUST00000122695 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Col5a3Q9JLI2 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Col5a3Q9JLI2 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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Col5a3Q9JLI2 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
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Col5a3Q9JLI2 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Col5a3Q9JLI2 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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