Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms