Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trdv4Q5R1A3 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trdv4Q5R1A3 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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