Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
Trappc1Q5NCF2 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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Trappc1Q5NCF2 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Trappc1Q5NCF2 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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