Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Rnf40Q3U319 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Rnf40Q3U319 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf40Q3U319 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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