Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxd13P70217 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxd13P70217 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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