Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PtprmP28828 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PtprmP28828 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PtprmP28828 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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