Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccl20O89093 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccl20O89093 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccl20O89093 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccl20O89093 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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