Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Nedd9O35177 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Nedd9O35177 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms