Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms