Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Col5a3Q9JLI2 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms