Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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OtofQ9ESF1 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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OtofQ9ESF1 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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OtofQ9ESF1 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
OtofQ9ESF1 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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