Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Riok3Q9DBU3 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Riok3Q9DBU3 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms